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創(chuàng)新的蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜應(yīng)用新技術(shù)

點擊次數(shù):3338 發(fā)布時間:2011/11/20
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      蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院及 AB SCIEX(的生命科學(xué)分析技術(shù)公司)的科學(xué)家匯聚一堂,公布一項基于質(zhì)譜應(yīng)用的新技術(shù),利用此項技術(shù),科學(xué)家有史以來可以獲得單獨蛋白質(zhì)組學(xué)樣品分析中每個肽段的數(shù)據(jù)。S WATH 采集模式 是一項重大技術(shù)突破,使用質(zhì)譜研究蛋白質(zhì)組學(xué)的用戶得以獲知整個蛋白質(zhì)組的完整數(shù)據(jù)。在與蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院 Ruedi Aebersold 博士進行的 MRMAtlas 合作的過程中,AB SCIEX 將開發(fā) MS/MSALL 增強功能,使 AB SCIEX TripleTOF™ 5600 系統(tǒng)可以運行 SWATH 采集模式供科學(xué)家使用。有關(guān) SWATH 的詳情將于本周在丹佛召開的美國質(zhì)譜協(xié)會 (American Society of Mass Spectrometry, ASMS) 會議上公布。

      SWATH 采集模式是 Aebersold 博士及其在蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的團隊共同開發(fā),為未來的蛋白質(zhì)組學(xué)研究提供的一種新的工作流程,該系統(tǒng)預(yù)計將產(chǎn)生令人震撼的蛋白質(zhì)組學(xué)新發(fā)現(xiàn),并克服目前的質(zhì)譜平臺中因數(shù)據(jù)重復(fù)而給科學(xué)家?guī)淼睦Щ?。本技術(shù)關(guān)鍵優(yōu)勢在于其能提供樣品的完整定量與定性結(jié)果,該結(jié)果能按照提出的新假設(shè)經(jīng)電腦模擬進行回溯性的挖掘。

這一新技術(shù)是對 MRMAtlas 的補充,MRMAtlas 以質(zhì)譜技術(shù)為基礎(chǔ),向大多數(shù)人類蛋白質(zhì)組提供研究平臺。科學(xué)家利用這一圖譜極大推進了生物標(biāo)志物研究、蛋白藥物開發(fā)、基礎(chǔ)生物及生物醫(yī)學(xué)研究。MRMAtlas 提供簡單及有效分析能力,探索蛋白質(zhì)組中前所未見的新領(lǐng)域。利用 TripleTOF 5600 系統(tǒng)的 SWATH 采集模式,將有更多科學(xué)家能使用 MRMAtlas。

現(xiàn)有高分辨率及軌道阱質(zhì)譜系統(tǒng)僅能定性檢測出復(fù)雜樣品中的蛋白質(zhì)子集,因為它們 MS/MS 獲取速度相對較慢,且為探知更準(zhǔn)確的定量結(jié)果,常常會采用其他儀器再次進樣分析樣品。面對這些挑戰(zhàn),AB SCIEX 開發(fā)出 SWATH 采集模式可以在單一進樣分析中同時對所有蛋白質(zhì)與肽進行定量與定性檢測。

與 Aebersold 博士及其團隊共同展開的這一活動還將繼續(xù)開發(fā)軟件處理方法,更好解析 MRMAtlas 的數(shù)據(jù)。SWATH 采集模式 是 AB SCIEX 的 MS/MSALL 技術(shù)的延伸,只能在 TripleTOF™ 5600 上完成,這是因為需要將*的采集速度與定量能力、質(zhì)量及高分辨率整合在一起方可實現(xiàn)。MS/MSALL 以前已成功用于脂質(zhì)組學(xué)及特種結(jié)構(gòu)表達?,F(xiàn)在進一步擴展此能力,MS/MSALL 采用 SWATH 采集模式,極大提高了工作效率,因此可以結(jié)合 LC/MS --, 顯著提高了質(zhì)譜技術(shù)。

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